Нет выбора, кроме как предать Землю

Через два года после последнего крупного конфликта с фестумами жизнь на острове Тацумия постепенно возвращается к обычному ритму. Кадзуки Макабэ, ожидающий возвращения Соси Минасиро, начинает сомневаться в выполнении данного ей обещания. Ситуация меняется, когда в бухте острова появляется неизвестная подводная лодка, а на её палубе — молодой человек по имени Мисао Курусу.

Мисао заявляет, что он послан Соси Минасиро, и предупреждает о приближении нового конфликта. Его появление приводит к возобновлению активного противостояния между людьми и фестумами. Кадзуки и другие пилоты фафниров вынуждены снова занять свои места в боевых машинах, чтобы противостоять угрозе.

Предстоящее столкновение имеет потенциал повлиять на будущее обеих сторон — человечества и фестумов. Исход этого противостояния определит дальнейшее развитие событий на острове Тацумия и может привести к значительным изменениям в сложившемся порядке вещей.